296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1911 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0279  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446741  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1911  5S RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00279415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 115 bp  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0059  5S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 116 bp  95.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0005  5S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0015  5S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.651632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0075  5S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 116 bp  87.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3398  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.495724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0472  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000566634  normal  0.0381897 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0016  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0354565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0103  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SA  5S ribosomal RNA  88.61 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SB  5S ribosomal RNA  88.61 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.729876  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0630  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000525893  normal  0.0738312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0131  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0232542  normal  0.0763062 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3468  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.119898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1923  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0302252  normal  0.557773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0104  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0033867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4192  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00523056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4196  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000940838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4218  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00106979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4262  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4282  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000174776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4290  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00943464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4300  5S ribosomal RNA  86.09 
 
 		 116 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0179371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0102  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0101  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.068415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0099  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0795663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0052  5S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 122 bp  81.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0083  5S ribosomal RNA  85.86 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0010  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.137185  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0095  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0491414  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0019  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0647157  hitchhiker  0.00427171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0082  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295466  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0106  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0633136  hitchhiker  0.000000553763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0105  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0106  5S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0022  5S ribosomal RNA  85.88 
 
 		 122 bp  73.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0009  5S ribosomal RNA  85.88 
 
 		 122 bp  73.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0003  5S ribosomal RNA  85.88 
 
 		 122 bp  73.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.491574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0018  5S ribosomal RNA  85.88 
 
 		 122 bp  73.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00138845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0632  5S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000577559  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4208  5S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 120 bp  71.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0038  5S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0101  5S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0880096  normal  0.361912 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0007  5S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.156774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0029  5S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0932548  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06827  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03717  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03612  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00193  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00199  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00247  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00326  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00374  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00472  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01013  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0034  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000354404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0041  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0049  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0045  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.367607  normal  0.064154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00004  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00008  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00013  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.556754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00016  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00019  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4462  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256702  hitchhiker  0.00629285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0100  5S ribosomal RNA  82.61 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.390638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4419  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000753188  hitchhiker  0.00225378 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5107  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0005  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.751826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0012  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0020  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0027  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0079  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0560482  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0199  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4109  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3054  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4325  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.806552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4465  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.824803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5053  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.682071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5084  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.478854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5074  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0500147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5007  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4807  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4761  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4734  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.01834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4783  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0107197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4802  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2069a  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 124 bp  63.9  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0219  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0482781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3569  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802154  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2741  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4236  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109899  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4128  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0828263  normal  0.309773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>