298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_R0011 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  93.04 
 
 		 115 bp  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 115 bp  123  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 115 bp  123  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 121 bp  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 121 bp  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 121 bp  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 120 bp  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 121 bp  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 121 bp  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 121 bp  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0042  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.190599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0019  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0404714  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0032  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0035  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0013  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0102843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0028  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0030  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0016  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000743511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 113 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0138  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0006  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000035078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0009  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0900632  hitchhiker  0.000000917011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0003  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000245604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0004  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.13622  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0021  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.973202  normal  0.0141597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0012  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0020  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0026  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0619749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0023  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0017  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0025  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0029  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0090  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 116 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0138  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0152  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0147  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0003  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0006  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0012  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0029  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0119  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0127  5S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 115 bp  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0005  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0015  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.651632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0075  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08610  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 132 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55620  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 132 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.431806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62050  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 132 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70870  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 132 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6149  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.989968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5399  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0966302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4842  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0815  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 120 bp  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0115  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 115 bp  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0134  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 115 bp  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0134181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r003  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r006  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r009  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r010  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r013  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r016  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r019  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r025  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0003  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.530292  hitchhiker  0.00148458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0011  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0219912  normal  0.295401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0018  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000474552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0075  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0121  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.777724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0130  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0134  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00025818  hitchhiker  0.00693749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0138  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0141  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0395  hypothetical protein  91.11 
 
 		 129 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000730757  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0003  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377147  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0011  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0018  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0024  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000358593  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0028  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0075  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0121  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0139  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0142  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 116 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0003  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95198  hitchhiker  0.000000732867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0018  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0073  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.568148  normal  0.279617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0118  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130a  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000239315  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0132  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000272918  normal  0.0785427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0138  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0141  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 120 bp  99.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>