296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_R0011 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_r003  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r006  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r009  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r010  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r013  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r016  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r022  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r025  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.530292  hitchhiker  0.00148458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0219912  normal  0.295401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0018  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000474552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0075  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0121  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.777724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0130  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0134  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00025818  hitchhiker  0.00693749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0138  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0141  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377147  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0018  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000358593  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0028  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0075  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0121  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0139  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0142  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95198  hitchhiker  0.000000732867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0018  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0073  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.568148  normal  0.279617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0118  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0128  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0132  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000272918  normal  0.0785427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0138  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0141  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_r019  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0395  hypothetical protein  100 
 
 
129 bp  224  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000730757  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130a  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  224  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000239315  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0011  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 
120 bp  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410694  normal  0.754666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
121 bp  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
121 bp  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
121 bp  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
120 bp  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
121 bp  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
121 bp  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
121 bp  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0023  5S ribosomal RNA  97.41 
 
 
120 bp  206  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0138  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0029  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0017  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0025  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0023  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
116 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0021  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.973202  normal  0.0141597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0003  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000245604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0004  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.13622  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0029  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0020  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0016  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000743511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0032  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0035  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0090  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0042  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.190599  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0006  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000035078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0138  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0009  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0900632  hitchhiker  0.000000917011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0012  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0030  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0147  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0026  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0619749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0152  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0003  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0006  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0012  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0144  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.166391  hitchhiker  0.000347328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0119  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0127  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0019  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0404714  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 
121 bp  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0611627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 
121 bp  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0102  5S ribosomal RNA  100 
 
 
121 bp  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0313304  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0109  5S ribosomal RNA  100 
 
 
121 bp  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0125839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0112  5S ribosomal RNA  100 
 
 
121 bp  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0502775  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0114  5S ribosomal RNA  100 
 
 
132 bp  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473719  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0120  5S ribosomal RNA  100 
 
 
121 bp  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0534587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0123  5S ribosomal RNA  100 
 
 
121 bp  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719987  normal  0.315089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0028  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0013  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 
115 bp  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0102843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  96.46 
 
 
113 bp  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0163  5S ribosomal RNA  99.01 
 
 
115 bp  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0130  5S ribosomal RNA  99.01 
 
 
115 bp  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360206  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0141  5S ribosomal RNA  99.01 
 
 
115 bp  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0157  5S ribosomal RNA  99.01 
 
 
115 bp  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884697  normal  0.0459109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>