133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0029 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  89.61 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  89.61 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  89.61 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0034  5S ribosomal RNA  85.86 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0051  5S ribosomal RNA  85.86 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0058  5S ribosomal RNA  85.86 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0061  5S ribosomal RNA  85.86 
 
 		 116 bp  77.8  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 120 bp  75.8  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 120 bp  75.8  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0013  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0618011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 123 bp  63.9  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  87.32 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0026  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 128 bp  58  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0026  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.255139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 118 bp  56  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0007  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 129 bp  54  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0033  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 129 bp  54  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341902  normal  0.519563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0041  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 129 bp  54  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.114691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  86.57 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0015  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0072  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0075  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000486693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 110 bp  54  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0030  5S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000331243  normal  0.673605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0050  5S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.973161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0077  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0078  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0068  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0067  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0017  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0024  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0030  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539781  decreased coverage  0.000469823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0054  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0160021  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0053  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0159173  normal  0.653325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 129 bp  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 129 bp  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 129 bp  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0019  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0033  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0032  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0020  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0031  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0034  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 128 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0036  5S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481647  hitchhiker  0.00452682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 124 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0004  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.357792  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0028  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.678943  hitchhiker  0.00874775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0020  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.34124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0021  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.340088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0036  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0195143  hitchhiker  0.00974115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>