72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_R0005 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0052  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0075  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 98 bp  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 64 bp  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 123 bp  79.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 123 bp  79.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 128 bp  79.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 123 bp  79.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 123 bp  79.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 123 bp  79.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  95.65 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  95.65 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  95.65 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  95.65 
 
 		 115 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0055  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0054  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0037  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0036  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0012  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0011  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0075  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 115 bp  60  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000486693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0072  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 115 bp  60  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0015  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 115 bp  60  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 124 bp  60  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0001  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 110 bp  58  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.119355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0002  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 110 bp  58  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 115 bp  58  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 117 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 129 bp  54  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 129 bp  54  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 		 129 bp  54  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 117 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 117 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 116 bp  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 110 bp  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 114 bp  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 117 bp  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 113 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 114 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 114 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 114 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 114 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 113 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 114 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0036  5S ribosomal RNA  88.64 
 
 		 114 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481647  hitchhiker  0.00452682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0013  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0618011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 117 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0040  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 115 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.852672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0036  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 115 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0005  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 115 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0024  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>