121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0022 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0022  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0010  5S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 113 bp  93.7  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0024  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0055  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0551184  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0008  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 110 bp  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0171823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0007  5S ribosomal RNA  95.12 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_r3  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 118 bp  60  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0044  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 110 bp  60  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0049  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 110 bp  60  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.660583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0007  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 108 bp  60  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0012  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 108 bp  60  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0929617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0007  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 109 bp  60  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0012  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 109 bp  60  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0052  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903426  normal  0.0492547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0020  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00562128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0045  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 112 bp  58  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0026  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 111 bp  58  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0029  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 111 bp  58  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0032  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 111 bp  58  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0905853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0034  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 111 bp  58  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0039  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 111 bp  58  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0236857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0044  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 111 bp  58  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0008  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 110 bp  58  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0014  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 110 bp  58  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0038  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 110 bp  58  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274795  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0054  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 110 bp  58  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00998637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 132 bp  56  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 132 bp  56  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG5SA  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 108 bp  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SB  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 108 bp  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SC  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 108 bp  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SD  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 108 bp  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0051  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 110 bp  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0054  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 110 bp  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00173514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0021  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0034  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0056  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0213918  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0007  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 107 bp  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0007  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 109 bp  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0012  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 109 bp  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0027  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 109 bp  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0057  5S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0008  5S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0006  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.449414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  80.95 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  80.95 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0030  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.476449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0042  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0009  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0003  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000187832  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TCrrnaA5S  5S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 151 bp  48.1  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TCrrnaB5S  5S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0025  5S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0784313  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0046  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r5S01  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 37 bp  44.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r5S02  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 37 bp  44.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r5S03  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 37 bp  44.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00874161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0001  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0055  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0061  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0067  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>