43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_r5S03 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_r5S01  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 37 bp  73.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r5S02  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 37 bp  73.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r5S03  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 37 bp  73.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00874161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SB  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 108 bp  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SC  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 108 bp  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SD  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 108 bp  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0008  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 110 bp  65.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0171823 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SA  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 108 bp  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0045  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0026  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 111 bp  61.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0029  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 111 bp  61.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0032  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 111 bp  61.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0905853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0034  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 111 bp  61.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0044  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 111 bp  61.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0024  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 117 bp  61.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0010  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 113 bp  61.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0039  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 111 bp  61.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0236857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0036  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 112 bp  56  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0029  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 112 bp  56  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.364551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0024  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 112 bp  56  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0011  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 112 bp  56  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0007  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 109 bp  54  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0051  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 110 bp  54  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0027  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 109 bp  54  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0012  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 109 bp  54  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0007  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 109 bp  54  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0007  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 107 bp  54  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0012  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 109 bp  54  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0054  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 110 bp  54  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00173514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0067  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 120 bp  54  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0061  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 120 bp  54  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0055  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 120 bp  54  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0049  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 120 bp  54  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0015  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 120 bp  54  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0001  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 120 bp  54  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0007  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 108 bp  46.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0012  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 108 bp  46.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0929617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0049  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 110 bp  46.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.660583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0044  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 110 bp  46.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_r3  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 118 bp  46.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0022  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1370  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 36 bp  42.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0656  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 36 bp  42.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.757563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>