97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG5SB on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG5SB  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SC  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SD  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG5SA  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0008  5S ribosomal RNA  94.37 
 
 		 110 bp  101  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0171823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0045  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 		 112 bp  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0024  5S ribosomal RNA  92.06 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0012  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 109 bp  85.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0007  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 109 bp  85.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0012  5S ribosomal RNA  86.75 
 
 		 109 bp  77.8  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0010  5S ribosomal RNA  92.73 
 
 		 113 bp  77.8  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0027  5S ribosomal RNA  86.75 
 
 		 109 bp  77.8  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0007  5S ribosomal RNA  86.75 
 
 		 109 bp  77.8  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0051  5S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 110 bp  69.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0044  5S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 110 bp  69.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0026  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0032  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0905853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0039  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0236857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0044  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0049  5S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 110 bp  69.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.660583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0054  5S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 110 bp  69.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00173514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r5S03  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 37 bp  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00874161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r5S02  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 37 bp  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r5S01  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 37 bp  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0024  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0011  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0029  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.364551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0036  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_r3  5S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 118 bp  61.9  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0001  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0015  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0049  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0055  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0061  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0067  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0057  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0012  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 108 bp  54  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0929617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0008  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0007  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 108 bp  54  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117205  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0022  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1370  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 36 bp  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0656  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 36 bp  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.757563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0007  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 107 bp  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0003  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0009  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0412  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 124 bp  46.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0961397  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0008  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 110 bp  46.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0014  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 110 bp  46.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0038  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 110 bp  46.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274795  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0054  5S ribosomal RNA  93.55 
 
 		 110 bp  46.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00998637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 111 bp  46.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0022  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 124 bp  46.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0311578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0082  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 124 bp  46.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 111 bp  46.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0171  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 124 bp  46.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.114955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0184  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 127 bp  46.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00848557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1781  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 127 bp  46.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.386687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0007  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.069433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0784313  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0027  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0583618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0046  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05550  hypothetical protein  81.71 
 
 		 255 bp  44.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r136751  5S ribosomal RNA  81.71 
 
 		 110 bp  44.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.913461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1618  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.636533 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0062  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 121 bp  44.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000016841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0077  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 121 bp  44.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0030  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539781  decreased coverage  0.000469823 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1803  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1797  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.20962e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0451  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0011  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 120 bp  44.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1583  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1564  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>