222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_r136751 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05550  hypothetical protein  100 
 
 		 255 bp  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r136751  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 110 bp  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.913461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0055  5S ribosomal RNA  84.54 
 
 		 120 bp  73.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0001  5S ribosomal RNA  84.54 
 
 		 120 bp  73.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0061  5S ribosomal RNA  84.54 
 
 		 120 bp  73.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0049  5S ribosomal RNA  84.54 
 
 		 120 bp  73.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0015  5S ribosomal RNA  84.54 
 
 		 120 bp  73.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0067  5S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 120 bp  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0024  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0021  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0039  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0013  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  56  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0037  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  56  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0134704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 129 bp  54  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0022  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 114 bp  54  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 129 bp  54  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 129 bp  54  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0083  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0086  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05582  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00903863  normal  0.193951 
 
 
-
 
NC_003295  RS05739  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0893083  normal  0.824943 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm5SC  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0456447  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm5SD  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00449174  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0089  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.826807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0001  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0021  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0063  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00759396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1477  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3558  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0088  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322083  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0009  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0019  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000864469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401927  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0071  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425687  normal  0.592263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0070  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47652  normal  0.759465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.52779  normal  0.472403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0016  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000150605  normal  0.0430285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0051  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0062  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0224651  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0075  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0087  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0001  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0081  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.567884  normal  0.932493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0063  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0077  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0086  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 113 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.778781  normal  0.0260386 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0988602  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0925  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00633245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1991  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1332  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3539  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3768  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000330068  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0595  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.884038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1341  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3565  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0498  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0907  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.424601  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1894  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0186999  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3544  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0021  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0488476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>