102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0039 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0021  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0039  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0047  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.906492 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0082  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.831714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0067  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.360556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0075  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00798302  normal  0.222372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0006  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0364789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0037  5S ribosomal RNA  85.06 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0046  5S ribosomal RNA  85.06 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0058  5S ribosomal RNA  85.06 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0008  5S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 120 bp  67.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0066  5S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 120 bp  67.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0008  5S ribosomal RNA  93.02 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0022  5S ribosomal RNA  93.02 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0042  5S ribosomal RNA  93.02 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0060  5S ribosomal RNA  93.02 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0040  5S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0050  23S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6010  5SrRNA  84.93 
 
 		 118 bp  58  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.810803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6017  5SrRNA  84.93 
 
 		 118 bp  58  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6503  5S ribosomal RNA  83.15 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6506  5S ribosomal RNA  83.15 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4503  5S ribosomal RNA  83.15 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4506  5S ribosomal RNA  83.15 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r136751  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 110 bp  58  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.913461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05550  hypothetical protein  89.8 
 
 		 255 bp  58  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0040  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.498325 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0052  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.678773 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0059  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.556959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0067  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.874894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 114 bp  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 114 bp  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0045  5S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 114 bp  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0061  5S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 114 bp  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0006  5S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0039  5S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320086  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_r3  5S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0359227  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0043  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0044  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0037  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0038  5S ribosomal RNA  80.56 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0047  5S ribosomal RNA  80.56 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0060  5S ribosomal RNA  80.56 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0036  5S ribosomal RNA  80.56 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0045  5S ribosomal RNA  80.56 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0058  5S ribosomal RNA  80.56 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0017  5S ribosomal RNA  82.28 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0183737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4293  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4357  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_r01  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 118 bp  46.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0051  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.205109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0022  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0005  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0036  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0040  5S ribosomal RNA  83.1 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.852672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0006  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 118 bp  46.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0054  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 118 bp  46.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0061  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 118 bp  46.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0067  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 118 bp  46.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0050  5S ribosomal RNA  82.28 
 
 		 118 bp  46.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  normal  0.069231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0010  5S ribosomal RNA  82.28 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0022  5S ribosomal RNA  82.28 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0003  5S ribosomal RNA  82.67 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0006  5S ribosomal RNA  82.67 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  86.27 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0003  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0014  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0027  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0065  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0070  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0088  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.875375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>