162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1332 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1332  5S ribosomal RNA  100 
 
 
118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0595  5S ribosomal RNA  100 
 
 
118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.884038  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0907  5S ribosomal RNA  100 
 
 
118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.424601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3539  5S ribosomal RNA  100 
 
 
118 bp  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3768  5S ribosomal RNA  100 
 
 
118 bp  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000330068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3565  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35308  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1894  5S ribosomal RNA  100 
 
 
118 bp  230  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0186999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_5s_rrfB  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165355  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm5SC  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0456447  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm5SD  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00449174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0001  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000461312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1477  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3558  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1912  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0150114  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0988602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3105  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0639464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0007  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00293377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0925  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00633245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1991  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1341  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3829  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0498  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3544  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0006  5S ribosomal RNA  100 
 
 
113 bp  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.723567  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0013  5S ribosomal RNA  100 
 
 
113 bp  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000286071  normal  0.223631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0010  5S ribosomal RNA  100 
 
 
113 bp  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166624  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 
113 bp  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2043  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 
116 bp  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0131191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1100  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 
116 bp  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000292681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2894  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 
116 bp  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3091  5S ribosomal RNA  99.14 
 
 
116 bp  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000275614  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0077  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
113 bp  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552404  normal  0.045853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0060  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
113 bp  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127508  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0050  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
113 bp  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276696  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0070  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
113 bp  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0195092  hitchhiker  0.00000402185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0075  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
113 bp  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0262155  hitchhiker  0.00115285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0015  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
113 bp  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260373  hitchhiker  0.00590134 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0020  5S ribosomal RNA  98.31 
 
 
117 bp  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28534  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0010a  5S ribosomal RNA  98.29 
 
 
117 bp  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00320739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0001  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
117 bp  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0061  5S ribosomal RNA  98.28 
 
 
117 bp  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0076  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.885608  normal  0.494732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0065  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0023  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0267616  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0008  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000880421  hitchhiker  0.00620133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0081  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.567884  normal  0.932493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0001  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0063  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00759396  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0088  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322083  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0009  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0019  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000864469  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0029  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401927  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0071  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0005  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0011  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425687  normal  0.592263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0021  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0029  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106162  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0070  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0998455  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0080  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000339218  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0005  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47652  normal  0.759465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0011  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.52779  normal  0.472403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0016  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000150605  normal  0.0430285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0004  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0036  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0051  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0062  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0224651  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0075  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0087  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0011  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000846557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0021  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0080  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0083115  normal  0.01969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0086  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0207651  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0077  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0086  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.778781  normal  0.0260386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0086  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 
113 bp  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0089  5S ribosomal RNA  98.23 
 
 
112 bp  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.826807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0083  5S ribosomal RNA  98.23 
 
 
112 bp  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208795  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0001  5S ribosomal RNA  98.23 
 
 
112 bp  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0011  5S ribosomal RNA  98.23 
 
 
112 bp  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000918889  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0021  5S ribosomal RNA  98.23 
 
 
112 bp  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0488476  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0063  5S ribosomal RNA  98.23 
 
 
112 bp  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277113  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS00493  5S ribosomal RNA  94.78 
 
 
114 bp  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0275686  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS05582  5S ribosomal RNA  94.78 
 
 
114 bp  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00903863  normal  0.193951 
 
 
-
 
NC_003295  RS05739  5S ribosomal RNA  94.78 
 
 
114 bp  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0893083  normal  0.824943 
 
 
-
 
NC_003296  RS05424  ribosomal RNA-5S  94.78 
 
 
114 bp  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.133858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0060  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
113 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.534885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0063  5S ribosomal RNA  97.96 
 
 
97 bp  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0660998  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0054  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 
112 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0044  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
113 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0055  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
113 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0066  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
113 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.0321697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0051  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
113 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0041  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
113 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.742431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0043  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 
112 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0065  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 
112 bp  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509786  normal  0.0321697 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0083  5S ribosomal RNA  97.78 
 
 
89 bp  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152659  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0001  5S ribosomal RNA  97.65 
 
 
86 bp  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0048  5S ribosomal RNA  92.24 
 
 
133 bp  151  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0030  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
113 bp  147  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00451705  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0058  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
113 bp  147  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.639395  normal  0.537151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>