298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0052 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0020  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00562128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0052  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903426  normal  0.0492547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0055  5S ribosomal RNA  91.26 
 
 		 115 bp  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0551184  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0007  5S ribosomal RNA  91.26 
 
 		 115 bp  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0037  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0012  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00125226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0046  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0058  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4503  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 119 bp  67.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6503  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 119 bp  67.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0086  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919882  normal  0.263092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0081  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4506  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 119 bp  67.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0011  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.712208  hitchhiker  0.00122523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0006  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000380355  hitchhiker  0.00390757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0040  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0050  23S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6506  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 119 bp  67.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0060  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0047  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0058  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0036  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0038  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0045  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 114 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0013  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.149045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna48  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0243319  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna55  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0884571  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0022  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0078  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000574865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0070  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.45639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0021  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000104076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0045  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.367607  normal  0.064154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0061  5S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.488897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5749  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 111 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 111 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 111 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-5  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-7  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-8  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r27  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r28  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 127 bp  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 132 bp  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  96.43 
 
 		 132 bp  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>