34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1961 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  83.33 
 
 		 96 aa  166  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  79.17 
 
 		 96 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  77.08 
 
 		 97 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1568  50S ribosomal protein L21e  67.71 
 
 		 98 aa  142  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0148926 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3231  50S ribosomal protein L21e  54.17 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000418064  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  57.29 
 
 		 97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  55.21 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  56.25 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  54.64 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  53.61 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  52.58 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  53.61 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0765  Ribosomal protein L21e  42.71 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0624  50S ribosomal protein L21e  44.21 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535137  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2277  50S ribosomal protein L21e  44.79 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.644218  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1098  Ribosomal protein L21e  45.26 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  43.96 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2674  Ribosomal protein L21e  40.62 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.395884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  39.56 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2388  Ribosomal protein L21e  37.5 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1748  50S ribosomal protein L21e  39.33 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00441406  hitchhiker  0.00234817 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0578  50S ribosomal protein L21e  38.2 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00254948 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1729  50S ribosomal protein L21e  37.08 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.74633 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0355  50S ribosomal protein L21e  34.41 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1568  50S ribosomal protein L21e  36.36 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02170  60s ribosomal protein l21-a, putative  33.66 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.771683  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67316  predicted protein  39.06 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1384  50S ribosomal protein L21e  37.08 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46510  predicted protein  40.68 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04802  60S ribosomal protein L21, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06960)  37.5 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1954  ribosomal protein L21e  31.58 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46735  predicted protein  34.85 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27810  Ribosomal protein L21, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.67 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.186953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>