30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0765 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0765  Ribosomal protein L21e  100 
 
 
96 aa  190  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  50.54 
 
 
97 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1098  Ribosomal protein L21e  52.69 
 
 
102 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0624  50S ribosomal protein L21e  48.94 
 
 
98 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535137  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  47.92 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  46.88 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  46.88 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  48.91 
 
 
96 aa  95.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  44.79 
 
 
96 aa  94.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  46.88 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2674  Ribosomal protein L21e  48.94 
 
 
96 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.395884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  42.71 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2388  Ribosomal protein L21e  50.54 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2277  50S ribosomal protein L21e  46.74 
 
 
101 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.644218  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  43.48 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  42.71 
 
 
97 aa  87.8  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  44.09 
 
 
97 aa  87.8  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3231  50S ribosomal protein L21e  42.71 
 
 
97 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000418064  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1568  50S ribosomal protein L21e  44.57 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0148926 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  43.3 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  44.09 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0578  50S ribosomal protein L21e  41.94 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00254948 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1729  50S ribosomal protein L21e  41.94 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.74633 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1568  50S ribosomal protein L21e  43.48 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1748  50S ribosomal protein L21e  38.71 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00441406  hitchhiker  0.00234817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0355  50S ribosomal protein L21e  36.56 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1954  ribosomal protein L21e  31.58 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1384  50S ribosomal protein L21e  36.67 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46735  predicted protein  40.26 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02170  60s ribosomal protein l21-a, putative  32.89 
 
 
160 aa  43.5  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.771683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>