28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2277 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2277  50S ribosomal protein L21e  100 
 
 		 101 aa  207  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.644218  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1098  Ribosomal protein L21e  74.74 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2388  Ribosomal protein L21e  74.74 
 
 		 102 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2674  Ribosomal protein L21e  69.79 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.395884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0624  50S ribosomal protein L21e  70.53 
 
 		 98 aa  142  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535137  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  51.04 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1568  50S ribosomal protein L21e  51.04 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0148926 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  46.88 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  48.96 
 
 		 97 aa  94.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  48.91 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  43.3 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0765  Ribosomal protein L21e  46.74 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3231  50S ribosomal protein L21e  42.71 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000418064  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  45.83 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  44.79 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  44.57 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  44.57 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  43.48 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  42.71 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  37.78 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  37.36 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0578  50S ribosomal protein L21e  35.48 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00254948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1568  50S ribosomal protein L21e  35.48 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1729  50S ribosomal protein L21e  34.83 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.74633 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1748  50S ribosomal protein L21e  32.26 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00441406  hitchhiker  0.00234817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0355  50S ribosomal protein L21e  34.78 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1954  ribosomal protein L21e  27.47 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1384  50S ribosomal protein L21e  33.87 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>