30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1384 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1384  50S ribosomal protein L21e  100 
 
 		 99 aa  200  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  44.68 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1568  50S ribosomal protein L21e  42.55 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1748  50S ribosomal protein L21e  40.43 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00441406  hitchhiker  0.00234817 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1729  50S ribosomal protein L21e  41.94 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.74633 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0578  50S ribosomal protein L21e  41.94 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00254948 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0355  50S ribosomal protein L21e  39.13 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  38.46 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  35.96 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1954  ribosomal protein L21e  32.65 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  37.08 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  34.44 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  36.96 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  38.04 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  36.96 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0765  Ribosomal protein L21e  36.67 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  33.7 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  36.96 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1568  50S ribosomal protein L21e  35.16 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0148926 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3231  50S ribosomal protein L21e  35.16 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000418064  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  37.5 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  35.16 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  32.84 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46735  predicted protein  32.98 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27810  Ribosomal protein L21, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  26.04 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.186953 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67316  predicted protein  29.17 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02170  60s ribosomal protein l21-a, putative  33.72 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.771683  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2277  50S ribosomal protein L21e  33.87 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.644218  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46510  predicted protein  28.72 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1098  Ribosomal protein L21e  27.47 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>