22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46510 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_46510  predicted protein  100 
 
 		 158 aa  323  6e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67316  predicted protein  100 
 
 		 160 aa  321  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04802  60S ribosomal protein L21, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06960)  64.56 
 
 		 158 aa  214  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02170  60s ribosomal protein l21-a, putative  67.09 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.771683  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46735  predicted protein  49.07 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27810  Ribosomal protein L21, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  47.13 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.186953 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  37.5 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  37.5 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  36.46 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  36.46 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  38.71 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  40.68 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  38.71 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  38.98 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  35.11 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  32.63 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  37.7 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  32.79 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3231  50S ribosomal protein L21e  32.2 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000418064  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1568  50S ribosomal protein L21e  32.2 
 
 		 98 aa  42.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0148926 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  32.81 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1384  50S ribosomal protein L21e  28.72 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>