25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27810 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_27810  Ribosomal protein L21, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
168 aa  347  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.186953 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04802  60S ribosomal protein L21, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06960)  52.94 
 
 
158 aa  154  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02170  60s ribosomal protein l21-a, putative  48.41 
 
 
160 aa  142  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.771683  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67316  predicted protein  46.54 
 
 
160 aa  136  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46735  predicted protein  42.5 
 
 
163 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46510  predicted protein  47.13 
 
 
158 aa  135  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  33.67 
 
 
97 aa  50.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  35.11 
 
 
101 aa  48.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  31.63 
 
 
97 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  41.27 
 
 
96 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  31.63 
 
 
97 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  30.61 
 
 
97 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  34.67 
 
 
97 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  32.43 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  39.44 
 
 
97 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  33.33 
 
 
99 aa  44.7  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1098  Ribosomal protein L21e  33.33 
 
 
102 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1954  ribosomal protein L21e  31.53 
 
 
119 aa  44.3  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1729  50S ribosomal protein L21e  32.88 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.74633 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  32.43 
 
 
97 aa  43.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1748  50S ribosomal protein L21e  34.25 
 
 
100 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00441406  hitchhiker  0.00234817 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1384  50S ribosomal protein L21e  26.04 
 
 
99 aa  43.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  36.51 
 
 
96 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  34.25 
 
 
97 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0578  50S ribosomal protein L21e  31.51 
 
 
100 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00254948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>