27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2388 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2388  Ribosomal protein L21e  100 
 
 		 102 aa  209  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1098  Ribosomal protein L21e  74.51 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2277  50S ribosomal protein L21e  74.74 
 
 		 101 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.644218  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0624  50S ribosomal protein L21e  66.33 
 
 		 98 aa  142  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535137  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2674  Ribosomal protein L21e  67.37 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.395884 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0765  Ribosomal protein L21e  50.54 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  44.79 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  43.16 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  46.24 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  45.26 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1568  50S ribosomal protein L21e  43.16 
 
 		 98 aa  83.6  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0148926 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  43.01 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  44.21 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  43.01 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  41.94 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  39.78 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3231  50S ribosomal protein L21e  38.95 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000418064  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  38.95 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  37.5 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1729  50S ribosomal protein L21e  37.78 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.74633 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  40.66 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1568  50S ribosomal protein L21e  38.2 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0578  50S ribosomal protein L21e  35.56 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00254948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1748  50S ribosomal protein L21e  33.33 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00441406  hitchhiker  0.00234817 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  38.46 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0355  50S ribosomal protein L21e  34.41 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1954  ribosomal protein L21e  28.87 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>