129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0274 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0274  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  124  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0044  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.62 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.98 
 
 
269 aa  54.3  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  43.75 
 
 
313 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.89 
 
 
368 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0679  ferredoxin  47.17 
 
 
57 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  40.82 
 
 
396 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  42.22 
 
 
423 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  51.11 
 
 
594 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 
629 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  42 
 
 
392 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  47.83 
 
 
590 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  40 
 
 
426 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.83 
 
 
267 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
427 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  42.22 
 
 
393 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3208  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.23 
 
 
55 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000680801  hitchhiker  0.0000000456636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1033  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.31 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1303200000000001e-18  hitchhiker  0.00000903571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1528  ferredoxin  59.09 
 
 
279 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  40 
 
 
413 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  37.78 
 
 
414 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1086  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.98 
 
 
286 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0696553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1432  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0016771  normal  0.0451245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1309  ferredoxin  56.82 
 
 
279 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.510214  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.65 
 
 
591 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.65 
 
 
591 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  37.78 
 
 
415 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.98 
 
 
331 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  40 
 
 
431 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1322  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38 
 
 
267 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  39.02 
 
 
612 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  37.78 
 
 
417 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  40.74 
 
 
1299 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  37.78 
 
 
416 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2708  ferredoxin family protein  41.18 
 
 
56 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.67 
 
 
56 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  37.78 
 
 
413 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2882  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 
56 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000541835  normal  0.0204566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0989  ferredoxin  52.27 
 
 
279 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  41.3 
 
 
383 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2544  putative ferredoxin  40.38 
 
 
59 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  48.89 
 
 
306 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2105  ferredoxin  43.4 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  37.78 
 
 
375 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.92 
 
 
442 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  42.86 
 
 
288 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  37.78 
 
 
451 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0517  ferredoxin  40.43 
 
 
295 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 
55 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000062189  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.3 
 
 
255 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1753  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
55 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000316895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.83 
 
 
439 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0586  ferredoxin  47.73 
 
 
289 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  44 
 
 
592 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.65 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000195937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  37.78 
 
 
273 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 
398 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 
188 aa  42.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50 
 
 
268 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  37.78 
 
 
428 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
367 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1154  ferredoxin  50 
 
 
277 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.445743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.73 
 
 
635 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0483  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1955  ferredoxin  40.43 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1398  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0588445  normal  0.318627 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  39.13 
 
 
634 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  51.06 
 
 
628 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003579  radical activating enzyme  37.78 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  37.5 
 
 
272 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.84 
 
 
286 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000112559  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1421  ferredoxin, 4Fe-4S  42.86 
 
 
56 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1894  ferredoxin  38.46 
 
 
282 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000460706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  39.58 
 
 
458 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  41.3 
 
 
410 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.91 
 
 
426 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  39.13 
 
 
385 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0216  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.25 
 
 
282 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00676353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  35.56 
 
 
439 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  40 
 
 
310 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  34.78 
 
 
379 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2312  Fe binding transcriptional regulator FhlA  34.09 
 
 
747 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  37.78 
 
 
384 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 
593 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04760  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.89 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000206587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46 
 
 
271 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
55 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  41.67 
 
 
322 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1965  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  31.03 
 
 
517 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
350 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  37.78 
 
 
590 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
357 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  45.65 
 
 
610 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  39.13 
 
 
626 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00607284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1243  ferredoxin  39.58 
 
 
303 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2278  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
55 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1037  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 
56 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000342317  unclonable  0.00000000788382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>