More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0095 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  75.64 
 
 
424 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  74.2 
 
 
439 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  74.25 
 
 
423 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  100 
 
 
428 aa  892    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  75 
 
 
426 aa  669    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  75.69 
 
 
431 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  76.91 
 
 
427 aa  673    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  65.65 
 
 
414 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  64.67 
 
 
413 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  64.9 
 
 
413 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  62.79 
 
 
416 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  61.14 
 
 
417 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  59.95 
 
 
415 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  53.22 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  39.38 
 
 
384 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  35.24 
 
 
370 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  39.38 
 
 
321 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  40.07 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  37.07 
 
 
361 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  36.39 
 
 
381 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  36.39 
 
 
387 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  37.2 
 
 
396 aa  186  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  36.18 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.43 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  35.62 
 
 
366 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.51 
 
 
440 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.33 
 
 
403 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  35.12 
 
 
403 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.99 
 
 
406 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.99 
 
 
406 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.98 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  32.27 
 
 
439 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  34.35 
 
 
340 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  35.59 
 
 
360 aa  150  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  34.48 
 
 
320 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  35.69 
 
 
298 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  33 
 
 
299 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.78 
 
 
595 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
1409 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  36.16 
 
 
540 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  37.05 
 
 
537 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83457  predicted protein  34.93 
 
 
1108 aa  86.7  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180127  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  30.06 
 
 
1074 aa  86.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  39 
 
 
1342 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.91 
 
 
245 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
595 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
595 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  35.46 
 
 
1065 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  32.61 
 
 
1396 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  35.18 
 
 
1384 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.58 
 
 
588 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  29.58 
 
 
588 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.49 
 
 
591 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  34.75 
 
 
1065 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  35.11 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.62 
 
 
584 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.93 
 
 
607 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.75 
 
 
1065 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.82 
 
 
613 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  35.5 
 
 
554 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.75 
 
 
1065 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.7 
 
 
600 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37787  predicted protein  31.7 
 
 
1059 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  34.75 
 
 
1065 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.75 
 
 
1006 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  36.24 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  34.82 
 
 
534 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  33.78 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  33.84 
 
 
607 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  33.17 
 
 
609 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  34.68 
 
 
615 aa  80.5  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.33 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  32.3 
 
 
599 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  33.94 
 
 
1405 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.03 
 
 
613 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.33 
 
 
604 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  32.32 
 
 
612 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.75 
 
 
1065 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.65 
 
 
1395 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.75 
 
 
1065 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.75 
 
 
1065 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.93 
 
 
1401 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.14 
 
 
610 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.83 
 
 
604 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  33.48 
 
 
534 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  32.74 
 
 
535 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  33.98 
 
 
1397 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  33.48 
 
 
534 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  33.98 
 
 
1397 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  31.7 
 
 
599 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  32.14 
 
 
601 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  34.15 
 
 
1427 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.67 
 
 
600 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  33.17 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  38.55 
 
 
1312 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.85 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.59 
 
 
599 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  32.59 
 
 
599 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.9 
 
 
593 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  32.59 
 
 
599 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>