More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2512 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  95.13 
 
 
595 aa  1102    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  79.97 
 
 
593 aa  890    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
595 aa  1192    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  78 
 
 
589 aa  880    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  82.97 
 
 
589 aa  962    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  99.16 
 
 
595 aa  1184    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.93 
 
 
582 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  44.55 
 
 
600 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.76 
 
 
607 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.81 
 
 
614 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  40.53 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  39.07 
 
 
613 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.17 
 
 
600 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.2 
 
 
599 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38 
 
 
610 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  39.47 
 
 
614 aa  428  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  39.87 
 
 
631 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  39.04 
 
 
601 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.54 
 
 
599 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.18 
 
 
599 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.37 
 
 
599 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.25 
 
 
604 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.25 
 
 
604 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.18 
 
 
599 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.26 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  38.76 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.59 
 
 
607 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.5 
 
 
594 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  39.26 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  39.26 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.45 
 
 
604 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  38.92 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  39.09 
 
 
599 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  39.09 
 
 
599 aa  415  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  39.09 
 
 
599 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  38.76 
 
 
599 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.27 
 
 
596 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.87 
 
 
591 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.56 
 
 
607 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  38.82 
 
 
1407 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.23 
 
 
594 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.5 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  39.58 
 
 
602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  37.17 
 
 
599 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  42.28 
 
 
883 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  37.34 
 
 
599 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  39.17 
 
 
608 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  37.01 
 
 
599 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  37.17 
 
 
599 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.58 
 
 
599 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  35.93 
 
 
595 aa  404  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  38.6 
 
 
609 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  38.88 
 
 
599 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.72 
 
 
605 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.54 
 
 
610 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.44 
 
 
608 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.85 
 
 
613 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  37.34 
 
 
599 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.84 
 
 
598 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.58 
 
 
612 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  38.01 
 
 
1409 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.33 
 
 
584 aa  392  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  37.6 
 
 
609 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.7 
 
 
629 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  39.46 
 
 
1405 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  39.9 
 
 
628 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.88 
 
 
626 aa  385  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.74 
 
 
588 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  38.74 
 
 
588 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  36.75 
 
 
600 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  36.92 
 
 
600 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  38.61 
 
 
1397 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  36.2 
 
 
612 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  35.75 
 
 
1403 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.47 
 
 
1401 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  35.85 
 
 
1397 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  36.54 
 
 
969 aa  365  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.73 
 
 
1395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  34.95 
 
 
1384 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  37.84 
 
 
1400 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  37.7 
 
 
659 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  38.28 
 
 
1405 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  37.97 
 
 
1395 aa  350  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  37.97 
 
 
1395 aa  350  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  37.97 
 
 
1395 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  37.87 
 
 
1398 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.06 
 
 
1383 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  39.15 
 
 
1427 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0752  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.6 
 
 
612 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  36.19 
 
 
615 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  37.02 
 
 
1342 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0839  NADPH-sulfite reductase flavoprotein subunit  35.8 
 
 
612 aa  337  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.305761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  38.79 
 
 
1418 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  38.26 
 
 
1338 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  38.79 
 
 
1418 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  38.79 
 
 
1418 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  38.79 
 
 
1418 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  38.79 
 
 
1418 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  38.79 
 
 
1418 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  35.62 
 
 
1357 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>