58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0837 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  47.5 
 
 
123 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  44.26 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4884  hypothetical protein  46.72 
 
 
122 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0796  type IV pilus assembly PilZ  47.54 
 
 
121 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  43.97 
 
 
123 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  44.35 
 
 
127 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  41.88 
 
 
135 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4504  type IV pilus assembly PilZ  51.28 
 
 
120 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.833775  normal  0.872973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  42.24 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  42.24 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  42.24 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  44.35 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  44.35 
 
 
127 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4274  hypothetical protein  45.9 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043847  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  45.69 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4642  type IV pilus assembly PilZ  48.72 
 
 
128 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.769649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  38.79 
 
 
123 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  39.32 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4636  type IV pilus assembly PilZ  48.28 
 
 
121 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124678  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  39.66 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  39.13 
 
 
121 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  40.52 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  37.61 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  40.52 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60970  hypothetical protein  44.34 
 
 
125 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  40.52 
 
 
123 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  42.37 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  40.52 
 
 
123 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5248  hypothetical protein  43.4 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4049  hypothetical protein  42.37 
 
 
120 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1417  hypothetical protein  41.07 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2945  type IV pilus assembly PilZ  40.38 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454411  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  36.21 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3031  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 
135 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0590  type IV pilus assembly PilZ  36.75 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3884  hypothetical protein  35.96 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2110  type IV pilus assembly PilZ  44.07 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.623877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  36.21 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0609  type IV pilus assembly PilZ  38.58 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  37.19 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  31.62 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  31.58 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  29.06 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  26.5 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  30.51 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  29.57 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  26.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  33.05 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  26.21 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  24.14 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1289  type IV pilus assembly PilZ  25.41 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  28.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  21.55 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2445  type IV pilus assembly PilZ  22.22 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02990  hypothetical protein  25.98 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2769  type IV pilus assembly PilZ  29.17 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>