30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0336 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  40.18 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  34.75 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  33.9 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  32.77 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  34.23 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  32.48 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  28.07 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  27.97 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  35.96 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  40.66 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  29.67 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  30.97 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  30.97 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  29.73 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  26.27 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  26.72 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  25.21 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  24.37 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  24.37 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  25.83 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  20 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  25.86 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  25.93 
 
 		 244 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  25.53 
 
 		 120 aa  40  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>