20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1954 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 93 aa  191  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  63.22 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  60.92 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  44.94 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  39.33 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  35.96 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  45.16 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  32.14 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  37.08 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  32.56 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  32.56 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  35.23 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  30.34 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  32.22 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2519  type IV pilus assembly PilZ  28.74 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0949328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1173  type IV pilus assembly PilZ  35.59 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3900  hypothetical protein  38.6 
 
 		 91 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.121911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 134 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  24.69 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  24.42 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>