59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3538 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 124 aa  256  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  60.33 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  39.52 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  37.07 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  39.09 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  38.18 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  36.44 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  34.23 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  37.17 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  34.88 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  39.33 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  31.4 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  30 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  24.79 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  29.27 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  30.23 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  29.09 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  21.05 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  29.09 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3353  type IV pilus assembly PilZ  29.46 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  29.13 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  30 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0883  type IV pilus assembly PilZ  31.82 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  28.18 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  30.63 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  28.18 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  26.45 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  28.83 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  29.91 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  26.72 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  24.79 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  29.73 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  25.45 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  24.79 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3884  hypothetical protein  26.13 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3285  type IV pilus assembly PilZ  25.22 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0590  type IV pilus assembly PilZ  30.7 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  25.22 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  24.14 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  22.94 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  23.68 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  26.09 
 
 		 300 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0266  hypothetical protein  25.62 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.485965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  27.2 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  23.08 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  21.93 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  21.62 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3031  type IV pilus assembly PilZ  24.19 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3900  hypothetical protein  30.16 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.121911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3234  type IV pilus assembly PilZ  22.61 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  21.05 
 
 		 122 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  26.67 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  32.73 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  23.42 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  23.42 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.79 
 
 		 239 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4049  hypothetical protein  29.66 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60970  hypothetical protein  28.43 
 
 		 125 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>