61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1192 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  248  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  41.32 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  39.52 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  41.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  34.48 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  34.48 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  29.66 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  30.97 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  32.48 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  33.61 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  33.62 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  32.23 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  29.75 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  31.93 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  33.61 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  32.23 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  33.61 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  33.61 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  34.92 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  30.51 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  30.59 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  29.81 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1417  hypothetical protein  29 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  27.93 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  29.41 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  29.41 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0266  hypothetical protein  25.42 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.485965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  28.16 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  29.41 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  27.87 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  25.83 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  21.19 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3285  type IV pilus assembly PilZ  32.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3353  type IV pilus assembly PilZ  31.67 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  32.22 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2945  type IV pilus assembly PilZ  30.25 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  31.46 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  26.89 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  26.89 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  25.81 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2668  hypothetical protein  37.36 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2110  type IV pilus assembly PilZ  27.59 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.623877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0918773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0590  type IV pilus assembly PilZ  33.64 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4049  hypothetical protein  30.7 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0883  type IV pilus assembly PilZ  32.58 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3031  type IV pilus assembly PilZ  28.44 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 335 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  30.34 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  30.34 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4884  hypothetical protein  24.17 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  27.62 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  25 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0609  type IV pilus assembly PilZ  29.52 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>