35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0923 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  40.18 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  36.44 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  34.15 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  32.48 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  30.09 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  32.17 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  28.41 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  29.2 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2110  type IV pilus assembly PilZ  30.95 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.623877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  30.34 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  31.71 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  22.02 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  30.58 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4049  hypothetical protein  32.74 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  23.68 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  27.91 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3285  type IV pilus assembly PilZ  25.64 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  27.83 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  23.68 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  27.91 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  23.68 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  28.32 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  22.03 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  29.2 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  27.5 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  28.32 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  29.2 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  26.89 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  20 
 
 		 123 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>