56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0757 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 123 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  59.5 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5248  hypothetical protein  60 
 
 		 125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60970  hypothetical protein  59.05 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4884  hypothetical protein  55.46 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4274  hypothetical protein  53.72 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  47.5 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4636  type IV pilus assembly PilZ  53.85 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4642  type IV pilus assembly PilZ  50.86 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.769649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0796  type IV pilus assembly PilZ  47.93 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4504  type IV pilus assembly PilZ  51.72 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.833775  normal  0.872973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  42.48 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  43.1 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  43.59 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  44.44 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  47.06 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  41.38 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  41.38 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  43.97 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  43.24 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  45.45 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  40.87 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  45.83 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  45.22 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  41.44 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  39.66 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  39.66 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  44.74 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  39.67 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  38.79 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  38.79 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  35.34 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2110  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.623877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3031  type IV pilus assembly PilZ  39.37 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0590  type IV pilus assembly PilZ  35.54 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3884  hypothetical protein  35.54 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  36.59 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4049  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2945  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  35.83 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0609  type IV pilus assembly PilZ  36.07 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  36.44 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  33.02 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1289  type IV pilus assembly PilZ  27.13 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1417  hypothetical protein  32.14 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3285  type IV pilus assembly PilZ  35.29 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  24.79 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  26.42 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  26.89 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2445  type IV pilus assembly PilZ  23.15 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3353  type IV pilus assembly PilZ  31.86 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0266  hypothetical protein  28.45 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.485965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  22.94 
 
 		 117 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  20 
 
 		 124 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>