26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2430 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 117 aa  244  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  34.55 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  33.64 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  31.9 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  28.07 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  32.14 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  29.75 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  26.55 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  24.79 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  30.09 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  28.57 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  28.45 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  29.2 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  26.79 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3353  type IV pilus assembly PilZ  25.47 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  28.83 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  26.51 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  26.51 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  21.55 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1460  hypothetical protein  26.09 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0918773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  25.64 
 
 		 123 aa  42  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  24.77 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  22.94 
 
 		 123 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  27.59 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3900  hypothetical protein  31.15 
 
 		 91 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.121911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>