29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1460 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  230  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0918773  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3353  type IV pilus assembly PilZ  35.19 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0901  type IV pilus assembly PilZ  34.12 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  32.38 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  32.08 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  32.08 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  32.08 
 
 		 123 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3884  hypothetical protein  32.46 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  32.2 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  31.13 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  29.46 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  25.23 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2945  type IV pilus assembly PilZ  33.64 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  27.52 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  34.58 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  27.52 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3285  type IV pilus assembly PilZ  31.86 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  27.78 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  32.88 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  30.48 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  28.16 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  28.16 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  28.16 
 
 		 127 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>