53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2945 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2945  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
121 aa  235  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454411  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  56.03 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  56.52 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  56.03 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  40.38 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  43.14 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  38.79 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  42.62 
 
 
122 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  39.66 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  37.93 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  40.78 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4049  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  37.07 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  33.91 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  39.42 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  39.42 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3884  hypothetical protein  36.54 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  39.42 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1417  hypothetical protein  39.45 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  42.16 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  37.25 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  33.88 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0590  type IV pilus assembly PilZ  41.27 
 
 
125 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3031  type IV pilus assembly PilZ  37.39 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  34.48 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4884  hypothetical protein  37.7 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4274  hypothetical protein  41.8 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043847  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  32.69 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  37.25 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  32.46 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2110  type IV pilus assembly PilZ  38.79 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.623877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  38.02 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4504  type IV pilus assembly PilZ  43.09 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.833775  normal  0.872973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  29.81 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0609  type IV pilus assembly PilZ  37.7 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  34.62 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  29.13 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60970  hypothetical protein  39 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5248  hypothetical protein  39 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4642  type IV pilus assembly PilZ  39.84 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.769649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  33.02 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4636  type IV pilus assembly PilZ  34.71 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124678  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2445  type IV pilus assembly PilZ  25.45 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0796  type IV pilus assembly PilZ  36.21 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  30.25 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1289  type IV pilus assembly PilZ  27.35 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3285  type IV pilus assembly PilZ  37.38 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151513  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  29.31 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  29.31 
 
 
124 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  27.88 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>