31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2445 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2445  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 119 aa  244  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  33.94 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  33.61 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  35.14 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  33.03 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  29.36 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  32.71 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  28.18 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  30.28 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  30.28 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  30.28 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  30.28 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  28.21 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  28.81 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  25.93 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  24.55 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  25 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2945  type IV pilus assembly PilZ  25.45 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  29.09 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  23.15 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  25.69 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4636  type IV pilus assembly PilZ  29.36 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  22.52 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  23.58 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  22.22 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  27.36 
 
 		 124 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3031  type IV pilus assembly PilZ  25.93 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5248  hypothetical protein  26.67 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60970  hypothetical protein  26.67 
 
 		 125 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>