25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02990 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02990  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2110  type IV pilus assembly PilZ  29.55 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.623877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  28.12 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  26.77 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  25.98 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  25.2 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  25.2 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4884  hypothetical protein  27.34 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  25.78 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  29.06 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  26.36 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  26.72 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  29.41 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  28.12 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  31.54 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  27.69 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  29.06 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  26.72 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0590  type IV pilus assembly PilZ  26.98 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  25.4 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  25.4 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  25.19 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60970  hypothetical protein  27.27 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  24 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5248  hypothetical protein  27.27 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>