34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0166 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0166  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 412 aa  818    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000226787  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1397  hypothetical protein  46.83 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1229  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.21 
 
 		 386 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.45834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1407  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.88 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.63 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.8 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0950  oxidoreductase, GMC family  22.65 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1066  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.65 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23820  choline dehydrogenase-like flavoprotein  24.33 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.432756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.79 
 
 		 547 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 547 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  23.79 
 
 		 522 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.42 
 
 		 553 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.85 
 
 		 526 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.41 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1851  putative dehydrogenase  34.04 
 
 		 116 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  31.91 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.25 
 
 		 548 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  31.91 
 
 		 563 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  31.91 
 
 		 563 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.68 
 
 		 515 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.91 
 
 		 556 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  31.91 
 
 		 547 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04780  oxidoreductase  21.97 
 
 		 531 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.19 
 
 		 532 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.91 
 
 		 526 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  19.8 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  29.37 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.12 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  20.77 
 
 		 697 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  21.71 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  18.36 
 
 		 532 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  18.59 
 
 		 532 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0458  putative oxidoreductase  21.34 
 
 		 530 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>