27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1407 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  90.16 
 
 		 386 aa  712    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1229  glucose-methanol-choline oxidoreductase  89.9 
 
 		 386 aa  709    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.45834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1407  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 386 aa  775    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1397  hypothetical protein  62.44 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0166  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.88 
 
 		 412 aa  350  3e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000226787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 		 433 aa  146  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0950  oxidoreductase, GMC family  25.65 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1066  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.65 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23820  choline dehydrogenase-like flavoprotein  23.87 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.432756  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  21.5 
 
 		 745 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  20.63 
 
 		 629 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  20.53 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.6 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  20.53 
 
 		 563 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  20.53 
 
 		 563 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1428  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.97 
 
 		 544 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  21.73 
 
 		 515 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  22.76 
 
 		 697 aa  46.2  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1851  putative dehydrogenase  31.91 
 
 		 116 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.68 
 
 		 548 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.31 
 
 		 547 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  22.27 
 
 		 547 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.9 
 
 		 531 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.65 
 
 		 531 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.83 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.34 
 
 		 506 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.83 
 
 		 531 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>