29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0501 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 386 aa  777    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1407  glucose-methanol-choline oxidoreductase  90.16 
 
 		 386 aa  712    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1229  glucose-methanol-choline oxidoreductase  91.19 
 
 		 386 aa  721    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.45834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1397  hypothetical protein  61.93 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0166  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.63 
 
 		 412 aa  347  2e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000226787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.26 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1066  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0950  oxidoreductase, GMC family  25.18 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23820  choline dehydrogenase-like flavoprotein  23.22 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.432756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1428  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.22 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  21.17 
 
 		 629 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  20.89 
 
 		 745 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1851  putative dehydrogenase  33.68 
 
 		 116 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  20.16 
 
 		 515 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  22.13 
 
 		 697 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  19.77 
 
 		 563 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.49 
 
 		 548 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  19.77 
 
 		 563 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  19.77 
 
 		 563 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.29 
 
 		 548 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.29 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  18.39 
 
 		 547 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.12 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4942  choline dehydrogenase  57.5 
 
 		 520 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.953244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.42 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03531  GMC oxidoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G01770)  63.64 
 
 		 555 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.61 
 
 		 534 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.16 
 
 		 505 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>