21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1229 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  91.19 
 
 		 386 aa  721    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1407  glucose-methanol-choline oxidoreductase  89.9 
 
 		 386 aa  709    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1229  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 386 aa  779    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.45834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1397  hypothetical protein  62.18 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0166  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.21 
 
 		 412 aa  356  5e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000226787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.07 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23820  choline dehydrogenase-like flavoprotein  23.47 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.432756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1066  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.52 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0950  oxidoreductase, GMC family  24.52 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1428  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.58 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  21.05 
 
 		 629 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  22.32 
 
 		 697 aa  49.7  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22 
 
 		 515 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  21.57 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  20.53 
 
 		 563 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.47 
 
 		 505 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1851  putative dehydrogenase  32.63 
 
 		 116 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  20.53 
 
 		 563 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  20.53 
 
 		 563 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  20.04 
 
 		 745 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  21.88 
 
 		 547 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>