20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1397 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  799    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1407  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.44 
 
 		 386 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1229  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.18 
 
 		 386 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.45834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.93 
 
 		 386 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0166  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.83 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000226787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.17 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0950  oxidoreductase, GMC family  24.53 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1066  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.53 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23820  choline dehydrogenase-like flavoprotein  23.38 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.432756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1851  putative dehydrogenase  34.41 
 
 		 116 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  20 
 
 		 563 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  20 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  20 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  21.04 
 
 		 697 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.53 
 
 		 504 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  20.82 
 
 		 699 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.654464 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07267  conserved hypothetical protein  42 
 
 		 549 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.534506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.23 
 
 		 548 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  29.26 
 
 		 489 aa  43.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.78 
 
 		 511 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>