More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0359 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0359  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
459 aa  919    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0059  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.27 
 
 
454 aa  672    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf256  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.52 
 
 
460 aa  673    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf498  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 
458 aa  639    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.61 
 
 
468 aa  362  9e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.76 
 
 
464 aa  361  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  40.62 
 
 
470 aa  361  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  42.51 
 
 
470 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  39.91 
 
 
471 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  40.76 
 
 
464 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.53 
 
 
464 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.84 
 
 
479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.83 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.39 
 
 
513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.7 
 
 
469 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  40 
 
 
479 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  41.59 
 
 
467 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.19 
 
 
474 aa  353  5e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.48 
 
 
468 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.19 
 
 
486 aa  351  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.12 
 
 
473 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.3 
 
 
473 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.26 
 
 
468 aa  349  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.91 
 
 
479 aa  349  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  41.82 
 
 
472 aa  348  8e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  39.65 
 
 
476 aa  348  8e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.39 
 
 
468 aa  348  9e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.61 
 
 
470 aa  348  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.65 
 
 
482 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  40.53 
 
 
465 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  39.51 
 
 
482 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.78 
 
 
476 aa  348  1e-94  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.04 
 
 
468 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.17 
 
 
469 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.17 
 
 
469 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.17 
 
 
469 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.17 
 
 
469 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  41.11 
 
 
465 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.04 
 
 
468 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  38.92 
 
 
493 aa  347  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.88 
 
 
517 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.14 
 
 
493 aa  347  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.88 
 
 
509 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  41.11 
 
 
465 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.4 
 
 
476 aa  347  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.88 
 
 
509 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.67 
 
 
467 aa  346  4e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.52 
 
 
470 aa  346  5e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.27 
 
 
475 aa  346  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  41.11 
 
 
462 aa  345  8e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.95 
 
 
469 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.39 
 
 
470 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.39 
 
 
470 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.53 
 
 
462 aa  345  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.43 
 
 
468 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.95 
 
 
462 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  38.1 
 
 
501 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.54 
 
 
537 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.95 
 
 
469 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  39.27 
 
 
487 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  38.21 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.14 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  40 
 
 
462 aa  343  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0485  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.62 
 
 
466 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.43 
 
 
468 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  40.41 
 
 
493 aa  343  5e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.9 
 
 
475 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  37.88 
 
 
485 aa  342  7e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.04 
 
 
459 aa  342  8e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.61 
 
 
466 aa  342  9e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  39.33 
 
 
471 aa  342  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03113  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.82 
 
 
468 aa  341  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.82 
 
 
459 aa  341  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0424  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.4 
 
 
466 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  40 
 
 
482 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.84 
 
 
475 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  39.82 
 
 
464 aa  341  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.38 
 
 
465 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3511  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.18 
 
 
468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.58 
 
 
468 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.04 
 
 
489 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.31 
 
 
462 aa  339  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  38.21 
 
 
477 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.27 
 
 
464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.64 
 
 
471 aa  339  7e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.51 
 
 
458 aa  338  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.18 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.51 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0144  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.25 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.801647  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.07 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.13 
 
 
464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  37.93 
 
 
495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.7 
 
 
486 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.22 
 
 
462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  40 
 
 
482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.38 
 
 
470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.18 
 
 
470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.13 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.39 
 
 
478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.22 
 
 
480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>