More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0387 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0387  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.576972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1876  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  91.06 
 
 
192 aa  342  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  74.46 
 
 
192 aa  289  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.24 
 
 
212 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.14 
 
 
240 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.5 
 
 
160 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6969  hypothetical protein  52.91 
 
 
219 aa  175  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.51 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686516  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.26 
 
 
226 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.94 
 
 
206 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.79 
 
 
217 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.87 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3870  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.31 
 
 
257 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0939038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.22 
 
 
221 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.59 
 
 
199 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0360  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.41 
 
 
266 aa  160  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.63 
 
 
210 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.420797  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4672  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.6 
 
 
201 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.497967  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.37 
 
 
227 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.32 
 
 
253 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.333261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.9 
 
 
286 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.83 
 
 
263 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.3 
 
 
307 aa  158  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.69 
 
 
193 aa  158  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.67 
 
 
229 aa  158  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1072  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.06 
 
 
225 aa  158  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.91 
 
 
305 aa  158  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1167  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.31 
 
 
224 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.91 
 
 
305 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4381  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.12 
 
 
197 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.02 
 
 
196 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.87 
 
 
264 aa  157  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4701  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.29 
 
 
255 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493501  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  46.78 
 
 
206 aa  157  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0706  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG domain-containing protein  50.98 
 
 
197 aa  157  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2829  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.68 
 
 
419 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.8 
 
 
241 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.23 
 
 
264 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1783  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.5 
 
 
199 aa  156  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.54 
 
 
206 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.4 
 
 
344 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.87 
 
 
223 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  48.43 
 
 
241 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  48.43 
 
 
241 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  44.75 
 
 
206 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3017  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.42 
 
 
187 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4115  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.69 
 
 
184 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54 
 
 
267 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1269  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.93 
 
 
224 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090481  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.93 
 
 
258 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.88 
 
 
243 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.95 
 
 
267 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3879  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.24 
 
 
205 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.61 
 
 
282 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0550797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.45 
 
 
295 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  51.32 
 
 
231 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2129  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.97 
 
 
408 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838619  normal  0.0574467 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5811  hypothetical protein  51.92 
 
 
223 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6995  hypothetical protein  48.8 
 
 
247 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.68 
 
 
354 aa  154  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.098708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0243  putative lipoprotein  43.87 
 
 
342 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.955469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.32 
 
 
232 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.44 
 
 
247 aa  154  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1886  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.87 
 
 
342 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.23 
 
 
255 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.33 
 
 
197 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.95 
 
 
239 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.42 
 
 
187 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0540206  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.31 
 
 
231 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0061  hypothetical protein  50.61 
 
 
232 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1965  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.97 
 
 
233 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.46 
 
 
195 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.48 
 
 
249 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2711  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.86 
 
 
219 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.66 
 
 
187 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1336  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.7 
 
 
262 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.22 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4131  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.68 
 
 
421 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2488  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.03 
 
 
371 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.048272  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2851  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.3 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48 
 
 
259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0500  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.93 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2647  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.63 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  0.288591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2873  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.63 
 
 
222 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716515  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0398  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.55 
 
 
246 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.177632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6654  hypothetical protein  57.04 
 
 
190 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1391  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.2 
 
 
252 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1371  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 
250 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.57 
 
 
283 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4144  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.63 
 
 
282 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0575  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.53 
 
 
227 aa  151  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2770  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.78 
 
 
224 aa  150  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36007  normal  0.0902261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.97 
 
 
190 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4122  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.33 
 
 
263 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4415  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.29 
 
 
199 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.31 
 
 
195 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6254  hypothetical protein  53.1 
 
 
405 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.68 
 
 
244 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.62 
 
 
249 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1675  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.33 
 
 
259 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>