49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0354 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 109 aa  209  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  59.8 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  53.7 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  56.73 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  59.05 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  59.05 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  55.56 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  51.43 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  58.1 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  56.36 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  47.62 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  47.62 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  47.62 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  47.62 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  47.62 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  47.62 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  46.67 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  44.76 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  47.62 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  47.62 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  47.62 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  48.08 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  48.08 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  46.67 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  41.9 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  29.63 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32.97 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  35.24 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  34.62 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  35.05 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  25.74 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  32.65 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  24.47 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  32.18 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  31.76 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  29.79 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  33.96 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  38.24 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  32.58 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  32.58 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  32.58 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>