29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0460 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 113 aa  219  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  47.87 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3758  branched-chain amino acid transport  44.25 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  50.55 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6126  putative transmembrane protein  58.46 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.603631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2394  branched-chain amino acid transport  58.46 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0430  branched-chain amino acid transport  43.43 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000591514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  35.51 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  40.21 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  39.36 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  30.68 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  31.73 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  28.26 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  39.39 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  34.83 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  30.61 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  33.65 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  33.96 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  31.78 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  31.73 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  33.67 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  40.68 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  28.87 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  28.12 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>