38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1416 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  50.52 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  44.86 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  44.86 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  44.21 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  44.12 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  46.59 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  44.55 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  43.4 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  44.23 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  44.09 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  38.32 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  38.32 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  43.75 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  30.84 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  35.64 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  33.7 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  32 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  42.37 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  31.96 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  32 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  31 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  32.29 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6126  putative transmembrane protein  40 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.603631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2394  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  31.82 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3758  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  32.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>