26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1690 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  218  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  79.63 
 
 
112 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  77.78 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  76.85 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  79.63 
 
 
112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  79.63 
 
 
112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  79.63 
 
 
112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  78.7 
 
 
112 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  71.7 
 
 
107 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  70.75 
 
 
107 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  67.92 
 
 
107 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  40.62 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  47 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  34 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  36.46 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  35.63 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  31.73 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  38.3 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  31.91 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  32.18 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 
108 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 
108 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  27.88 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  28.87 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>