55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1961 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 109 aa  204  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  46.08 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  46 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  44 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  42.31 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  44.12 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  45.65 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  43.52 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  35.51 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  42.86 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3758  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  43.4 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  42.42 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  34.58 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  50 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6126  putative transmembrane protein  50.88 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.603631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2394  branched-chain amino acid transport  50.88 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  34 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  36.19 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  36.19 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0430  branched-chain amino acid transport  41 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000591514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  29 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  30 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  30 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  30 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  30 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  34.29 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  29.91 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  38.71 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  29 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  32 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  31.63 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  32.65 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  29.67 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  28 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  30.1 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  27 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  37.11 
 
 		 111 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  30.11 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  35.82 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  33.77 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  24.75 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  25.71 
 
 		 100 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>