33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2937 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 107 aa  205  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  92.52 
 
 		 107 aa  191  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  87.85 
 
 		 107 aa  182  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  80.19 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  79.25 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  80.19 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  71.7 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  47.42 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  38.3 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  38.3 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  34.83 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  41.49 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32.35 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  31.65 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  32.35 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  31.37 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  29.29 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  29.29 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  34.74 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  34.74 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  29.59 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  28.12 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  32.63 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>