66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2108 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
109 aa  210  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  48.45 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  47.42 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  45.83 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  45.26 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  44.79 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  45.26 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  43.16 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  43.16 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  43.16 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  43.16 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  30.68 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  30.3 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  29.63 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  35.16 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  38.96 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  46.43 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  30.93 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  30.93 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  29.9 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  31.96 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  30.93 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  30.93 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  30.93 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  33.66 
 
 
116 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  29.89 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  38.6 
 
 
95 aa  47.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  30.93 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  25.77 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  25.77 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  28.57 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  29.55 
 
 
108 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  31.58 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  28.87 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  34.83 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  30.39 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  31.63 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  34.02 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  34 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  34 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  34 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  28.71 
 
 
111 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  27 
 
 
111 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  34 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  34 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  34 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  38.46 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  24.77 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  32.1 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  33.78 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  27.59 
 
 
105 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  29.9 
 
 
166 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  34.34 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  27.78 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  34.15 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  27.37 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  25.53 
 
 
111 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>