48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0494 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  203  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  68.32 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  67.33 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  70.79 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  41.75 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  44.21 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  43.52 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  44.12 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  40.91 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  30.1 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  47.25 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  38.14 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  38.14 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  33.98 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  37.23 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  35.45 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  31.4 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  34.83 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  32.95 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  44.83 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  33.67 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  34.69 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  33.01 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  36.78 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  34.44 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  36.84 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  31.43 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  38.98 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  35.96 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  29.79 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  23.71 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  35.96 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  33.78 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  30.85 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  30 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0430  branched-chain amino acid transport  33.02 
 
 		 110 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000591514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  34.52 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  31.76 
 
 		 111 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>