33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1380 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 119 aa  230  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  43.88 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  42.31 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  44.55 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  40.95 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  42.16 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  45.45 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  44.32 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  44.32 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  36.54 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  42.11 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  34.38 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  48.48 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  38.83 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  35.58 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0430  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000591514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  38.14 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3758  branched-chain amino acid transport  33.01 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  30.53 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  35.87 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  35.16 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  31.63 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  34.21 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  38.24 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  29.67 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  43.14 
 
 		 101 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  35.44 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6126  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.603631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2394  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  34.15 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>